MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 87465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_016112	ATT	2	6	103855	103860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403481
2003	NC_016112	TGC	2	6	103896	103901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403481
2004	NC_016112	CGT	2	6	103967	103972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403481
2005	NC_016112	A	6	6	103982	103987	100 %	0 %	0 %	0 %	357403481
2006	NC_016112	CCGAAA	2	12	104118	104129	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	357403482
2007	NC_016112	GAA	2	6	104153	104158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403482
2008	NC_016112	CGG	2	6	104161	104166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403482
2009	NC_016112	AGC	2	6	104169	104174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403482
2010	NC_016112	GC	4	8	104184	104191	0 %	0 %	50 %	50 %	357403482
2011	NC_016112	GTC	2	6	104272	104277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403482
2012	NC_016112	T	6	6	104286	104291	0 %	100 %	0 %	0 %	357403482
2013	NC_016112	TGCGGC	2	12	104305	104316	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357403482
2014	NC_016112	GCC	2	6	104321	104326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403482
2015	NC_016112	GAA	2	6	104366	104371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403482
2016	NC_016112	GAT	2	6	104435	104440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403482
2017	NC_016112	TGA	2	6	104457	104462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403482
2018	NC_016112	CAA	2	6	104468	104473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403482
2019	NC_016112	TCAATG	2	12	104580	104591	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	357403482
2020	NC_016112	GC	3	6	104659	104664	0 %	0 %	50 %	50 %	357403482
2021	NC_016112	GTC	2	6	104696	104701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403482
2022	NC_016112	GGC	2	6	104800	104805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403482
2023	NC_016112	GTC	2	6	104822	104827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403482
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2029	NC_016112	AAGC	2	8	105275	105282	50 %	0 %	25 %	25 %	357403482
2030	NC_016112	ATTG	2	8	105363	105370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_016112	TGT	2	6	105378	105383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_016112	ACA	2	6	105409	105414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403483
2033	NC_016112	A	6	6	105494	105499	100 %	0 %	0 %	0 %	357403483
2034	NC_016112	CGG	2	6	105544	105549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403483
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2036	NC_016112	AG	3	6	105653	105658	50 %	0 %	50 %	0 %	357403483
2037	NC_016112	A	8	8	105688	105695	100 %	0 %	0 %	0 %	357403483
2038	NC_016112	TCG	2	6	105696	105701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403483
2039	NC_016112	GAT	2	6	105727	105732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403483
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2042	NC_016112	TGC	2	6	105850	105855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403483
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2044	NC_016112	TTATTT	2	12	105937	105948	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	357403483
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2046	NC_016112	CAT	2	6	105997	106002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403483
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2051	NC_016112	CGA	2	6	106096	106101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403483
2052	NC_016112	ATC	2	6	106112	106117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403483
2053	NC_016112	CAA	2	6	106151	106156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403483
2054	NC_016112	TTG	2	6	106157	106162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403483
2055	NC_016112	AATC	2	8	106199	106206	50 %	25 %	0 %	25 %	357403483
2056	NC_016112	AAT	2	6	106229	106234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403483
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2058	NC_016112	T	7	7	106296	106302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_016112	CG	3	6	106308	106313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2061	NC_016112	AAG	2	6	106370	106375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403484
2062	NC_016112	GAC	2	6	106405	106410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403484
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2073	NC_016112	CA	3	6	107076	107081	50 %	0 %	0 %	50 %	357403484
2074	NC_016112	TGG	2	6	107116	107121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403485
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2104	NC_016112	TCGG	2	8	109125	109132	0 %	25 %	50 %	25 %	357403487
2105	NC_016112	TAGG	2	8	109148	109155	25 %	25 %	50 %	0 %	357403487
2106	NC_016112	T	6	6	109160	109165	0 %	100 %	0 %	0 %	357403487
2107	NC_016112	TGT	2	6	109321	109326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403487
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2109	NC_016112	TA	3	6	109439	109444	50 %	50 %	0 %	0 %	357403487
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2119	NC_016112	A	7	7	110046	110052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_016112	TTTTA	2	10	110089	110098	20 %	80 %	0 %	0 %	357403488
2121	NC_016112	ATT	2	6	110125	110130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403488
2122	NC_016112	ATT	2	6	110137	110142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403488
2123	NC_016112	CGG	3	9	110149	110157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403488
2124	NC_016112	T	7	7	110181	110187	0 %	100 %	0 %	0 %	357403488
2125	NC_016112	CGG	2	6	110388	110393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403488
2126	NC_016112	TGT	2	6	110424	110429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403488
2127	NC_016112	GCA	2	6	110479	110484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403488
2128	NC_016112	GTG	2	6	110504	110509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403488
2129	NC_016112	GGGA	2	8	110551	110558	25 %	0 %	75 %	0 %	357403488
2130	NC_016112	GTGC	2	8	110622	110629	0 %	25 %	50 %	25 %	357403488
2131	NC_016112	TGT	2	6	110667	110672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403488
2132	NC_016112	A	6	6	110682	110687	100 %	0 %	0 %	0 %	357403488
2133	NC_016112	GCAG	2	8	110699	110706	25 %	0 %	50 %	25 %	357403488
2134	NC_016112	GGC	2	6	110845	110850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403488
2135	NC_016112	AAT	2	6	110865	110870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403488
2136	NC_016112	GTT	2	6	110874	110879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2137	NC_016112	GAGT	2	8	110978	110985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2138	NC_016112	TGA	2	6	111015	111020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403489
2139	NC_016112	CG	3	6	111086	111091	0 %	0 %	50 %	50 %	357403489
2140	NC_016112	AGG	2	6	111170	111175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403489
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2142	NC_016112	CAA	2	6	111214	111219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403489
2143	NC_016112	A	6	6	111241	111246	100 %	0 %	0 %	0 %	357403489
2144	NC_016112	A	6	6	111327	111332	100 %	0 %	0 %	0 %	357403489
2145	NC_016112	GGT	2	6	111348	111353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403489
2146	NC_016112	TGA	2	6	111434	111439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403489
2147	NC_016112	CTG	2	6	111499	111504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403489
2148	NC_016112	TTCAT	2	10	111543	111552	20 %	60 %	0 %	20 %	357403489
2149	NC_016112	GAT	2	6	111561	111566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403489
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2151	NC_016112	ATT	2	6	111712	111717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403489
2152	NC_016112	GGT	2	6	111795	111800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403489
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2155	NC_016112	GGTGTG	2	12	111913	111924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403489
2156	NC_016112	CAGT	2	8	111938	111945	25 %	25 %	25 %	25 %	357403489
2157	NC_016112	GCG	2	6	112033	112038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403489
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2160	NC_016112	GTCGCA	2	12	112161	112172	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357403489
2161	NC_016112	ATC	2	6	112276	112281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403489
2162	NC_016112	ATT	2	6	112287	112292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403489
2163	NC_016112	GGC	2	6	112294	112299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403489
2164	NC_016112	CGAT	2	8	112334	112341	25 %	25 %	25 %	25 %	357403489
2165	NC_016112	ATG	2	6	112406	112411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403489
2166	NC_016112	ATCC	2	8	112459	112466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2167	NC_016112	TCA	2	6	112474	112479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2168	NC_016112	AGCA	2	8	112540	112547	50 %	0 %	25 %	25 %	357403490
2169	NC_016112	GGA	2	6	112618	112623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403490
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2173	NC_016112	GAT	2	6	112740	112745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403490
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2185	NC_016112	TTG	2	6	113334	113339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403490
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2229	NC_016112	ATG	2	6	116380	116385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2230	NC_016112	GGT	2	6	116391	116396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2231	NC_016112	GTA	2	6	116397	116402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2232	NC_016112	GTA	2	6	116419	116424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2233	NC_016112	GAG	2	6	116478	116483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2234	NC_016112	TAA	2	6	116678	116683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2235	NC_016112	GA	3	6	116708	116713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2236	NC_016112	GCC	2	6	116732	116737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2237	NC_016112	AAG	2	6	116805	116810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2238	NC_016112	ATA	2	6	116865	116870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2239	NC_016112	A	7	7	116870	116876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2240	NC_016112	T	6	6	116886	116891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2241	NC_016112	CAA	2	6	116939	116944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2242	NC_016112	TAT	2	6	116985	116990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403493
2243	NC_016112	AGAA	2	8	116995	117002	75 %	0 %	25 %	0 %	357403493
2244	NC_016112	T	6	6	117041	117046	0 %	100 %	0 %	0 %	357403493
2245	NC_016112	TACCGA	2	12	117081	117092	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	357403493
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